Phenomics表型组学前沿论坛第十九期“表观转录调控和肿瘤”圆满举办

来源:上海国际人类表型组研究院 发布时间:2022-08-10

2022年8月9日晚,由上海国际人类表型组研究院、Phenomics表型组学期刊、复旦大学人类表型组研究院、中国生物物理学会表型组学分会共同举办的生命天眼论:Phenomics表型组学前沿论坛第十九期顺利开讲。

本次论坛特别邀请了中国科学院苏州生物医学工程技术研究所总工程师高山研究员,作了主题为“表观转录调控和肿瘤”的精彩报告。论坛由Phenomics表型组学期刊执行主编、复旦大学人类表型组研究院副院长丁琛教授主持。来自全国的2300余名专家、学者线上参加了本次论坛。

高山研究员

高山研究员,现任中国科学院苏州生物医学工程技术研究所总工程师,兼任农工党第十六届中央科技工作委员会委员,中国人类表型组研究协作组(HPCC)委员,中国生物工程学会常务理事,科学通报编委,Frontiers in Cell Biology编委。主要研究方向聚焦在肿瘤表观转录调控及免疫逃逸。高教授围绕恶性肿瘤的发生、发展和转移鉴定了一系列潜在的新靶点,为靶向和免疫治疗提供了若干新靶点和策略。首次阐释免疫治疗“超进展”或“假进展”的潜在标志物,并提出可能优化的靶向治疗和免疫治疗联合策略。鉴定维持癌细胞生存的必要基因LCDR/DMDRMR/PES1APMAP,以及他们表观调控的靶基因,从而维持癌细胞的生存和生长,进一步发展了相关靶向策略。他以通讯作者在Proc Natl Acad Sci U S A(2篇)、Science Advances、Cancer Research(2篇)、Cell Reports等杂志发表30多篇论文。公开专利10项(包括三个国际PCT),获得授权9个。

丁琛教授

论坛开始,主持人丁琛教授代表主办方对莅临的嘉宾及观众表示热烈欢迎,并对论坛的三个主要主办方上海国际人类表型组研究院(IHPI)、Phenomics表型组学期刊、复旦大学人类表型组研究院(HuPI)做了简要介绍,对演讲嘉宾高山研究员做了隆重介绍。

报告中,高山研究员首先解释了肿瘤发生过程中微环境的基本情况,指出基因组-转录组-蛋白质组加上表观遗传可以部分解释肿瘤的发生发展机制,同时随着技术进步,近些年研究人员逐步明确了RNA上的调控修饰也会影响肿瘤的产生。

随后,高山研究员重点介绍了表观转录调控与蛋白质组的修饰,指出RNA结合蛋白可以通过调控RNA或直接结合RNA来影响肿瘤的发生、发展和转移。长链非编码RNA在癌症中扮演了重要的角色,几乎可以覆盖蛋白质的所有功能。高山研究员团队通过一系列的体外实验,成功筛选并命名了一个新潜在癌症长链非编码RNA——DMDRMR,并继续发现一个经典的RNA结合蛋白IGF2BP3与DMDRMR结合,发现两者结合对细胞的影响是敲除IGFBP3或DMDRMR后无法复现的,因此推断出两者具有协同功能。其团队还通过实验证实了DMDRMR和IGFBP3可以影响细胞周期调控基因CDK4的稳定性,从而改变细胞增殖情况。在临床上针对肾透明细胞癌患者样品进行DMDRMR与IGFBP3的检测均发现了高表达,且该检测对于患者预后也有很好的预测性。

接着,高山研究员介绍了其团队针对癌细胞中长链非编码RNA的乙酰化进行的系统性研究,发现了新潜在癌症长链非编码RNA——LCDR。将LCDR敲除后,发现大量的癌症细胞出现了凋亡,进一步研究发现LCDR可通过与RNA结合蛋白hnRNP K结合,协同调控溶酶体上膜蛋白LAPTM5 mRNA的稳定性,从而控制癌细胞存活。其团队在临床上针对肺癌患者样本进行了检测,发现LCDR与hnRNP K确实呈现了高表达,可作为潜在的治疗靶点。

最后,高山研究员表示,其团队通过对公共数据库的解读,挖掘了HRAS基因,并已发现在肾透明细胞癌患者的生物样本中该基因转录后存在大量的m6A修饰,后续其团队还将对该基因展开进一步探索研究。

在精彩的报告后,高山研究员还与观众们展开了热烈讨论。观众们非常踊跃地提问,高山研究员也对每个问题作了详细的解答。

如有位观众提问:“人的免疫力是处于动态变化中的,在进行蛋白质组检测的时候经常测不到PD-1与PD-L1,但经常能检测到PD-L2。请问PD-1、PD-L1和PD-L2是扮演促癌还是抑癌的角色,是否有基因组或代谢组学上的解读?”高山研究员答复:“PD-1在普通细胞中的应答率比较低,平均下来大概在20-30%左右,进入淋巴细胞后的表达确实高,IFNγ的信号以及关联性质的MHC1会在分子层面对患者分类起到一定的指示作用。”另外有观众提问:“现在PD-1药物治疗队列的适应症包含了PD-1检测阴性的患者,您对这样的现象有何看法?”高山研究员回复:“首先在治疗过程中会存在一些反常的个例,其次不排除现行PD-1抗体检测的敏感性存在问题,最后也可能与PD-1存在异构体以不同形式发挥功能有关系。”

生命天眼论:Phenomics表型组学前沿论坛将持续为大家提供高质量的讲座,第二十期生命天眼论:Phenomics表型组学前沿论坛将于8月16号(下周二)晚上20:00-21:30举行,届时将由西安交通大学电信学部自动化学院、西安交通大学第一附属医院叶凯教授,带来主题为“基因组结构变异的检测、表征和功能”的报告。敬请各位同仁关注!

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