Phenomics表型组学前沿论坛第70期,9月12日晚20:00,赵方庆研究员:肠道菌群与健康:关联、因果与调控

来源:上海国际人类表型组研究院 发布时间:2023-09-08

  

讲座主题:肠道菌群与健康:关联、因果与调控

日期:2023年9月12日(周二)20:00-21:30

参与方式:

1. 腾讯会议(席位限定500人,先到先得!)

腾讯会议号:873-1725-7682(长期有效)

入会密码:582626(长期有效)

会议链接:https://meeting.tencent.com/dm/gp5vi1BR8660

2.“人类表型组计划”视频号直播

扫码关注视频号预约及观看直播:

(微信视频号直播)

主讲嘉宾介绍

赵方庆,国家杰青、中科院特聘研究员。现任中科院北京生科院科研部副主任、中国生物信息学会基因组信息学专委会主任、Briefings in Bioinformatics、Science Bulletin、Science China Life Sciences等期刊副主编或编委。

主要致力于建立高效的算法模型和实验技术,探索人体微生物与非编码RNA的结构组成与变化规律,以期解析它们与健康和疾病的关系。近年来,在Cell、Gut、Nature Biotechnology、Nature Computational Science、Nature Communications等刊物上发表通讯作者论文70余篇,其中十余篇入选ESI高被引论文。先后5次荣获“中国科学院优秀导师奖”(2017~2022)以及“中国科学院大学领雁奖章”(2020, 2022)、“中国科学院朱李月华优秀教师奖”(2020)、“中国科学院大学必和必拓导师奖”(2021)。

报告摘要

微生物组通常是指微生物群体和微生物群体基因组的总和,它的外延则包含了微生物群体和个体与其所在环境的相互作用关系。近年来,随着微生物组学的发展,我们对各个生态系统中(包括人的健康/疾病过程)微生物群落的结构组成有了初步认知,但是离全面理解微生物群落动态和功能,进而实现精准预测和靶向调控菌群对宿主的作用这一目标还相距甚远。其中,有一系列的因素限制了我们对微生物组与宿主互作的深入理解。首先,目前二者的互作机制研究主要集中在单一微生物尤其是特定病原体对宿主的影响上。然而由于微生物处于复杂、高度多样化和动态化的群落之中,现有的简单抽样以及基于特定生物模型(如小鼠)的互作机制研究,都会偏离真实,难以重现其全貌。其次,微生物与宿主互作的空间多组学检测技术仍不成熟。虽然多组学技术在该领域得到广泛应用,但仍未达到单细胞及原位检测的精度。最后,功能微生物组数据挖掘方法的缺乏,极大限制了微生物组与宿主互作关系的研究。在过去的十多年里,微生物组学领域积累了海量的数据信息,它们类型复杂、数量庞大,蕴含的价值更是不可估量。如何从海量零散的微生物组数据中挖掘出与人类健康和疾病紧密相关的信息,建立更为高效的算法模型和实验解析来解读复杂微生物组数据的内在规律,成为微生物组领域亟需突破的关键环节。

主持人介绍

赵兴明,复旦大学特聘教授、中山医院双聘教授,计算神经科学与类脑智能教育部重点实验室副主任。

目前主要从事人工智能与生物医学大数据交叉领域的研究,上海市青年科技启明星和上海市浦江人才计划入选者。他是IEEE Senior Member、IEEE SMC Technical Committee on Systems Biology共同主席、ACM SIGBIO China副主席、IEEE SMC Shanghai Chapter主席、IAPR TC20委员,并担任中国人工智能学会生物信息学与人工生命专委会等国内学术组织的主任、常务理事和委员,担任了IEEE/ACM TCBB和IEEE SMC Magazine等国际期刊的副主编。承担了国家自然科学基金重点、国家杰出青年基金、国家重点研发计划在内的多项科研课题,在Nature、Cell Metabolism、Nature Communications和IEEE TPAMI等国际期刊发表SCI论文130余篇,曾获教育部高校优秀成果(自然科学)二等奖和吴文俊自然科学一等奖。

主办单位

上海国际人类表型组研究院

Phenomics表型组学期刊

复旦大学人类表型组研究院

中国生物物理学会表型组学分会

近期新闻