2024年4月16日晚，由上海国际人类表型组研究院、Phenomics表型组学期刊、复旦大学人类表型组研究院、中国生物物理学会表型组学分会共同举办的生命天眼论：Phenomics表型组学前沿论坛第九十三期顺利开讲。

本次论坛特别邀请了复旦大学人类表型组研究院丁琛教授，作了主题为“蛋白质组学与精准医学”的精彩报告。论坛由复旦大学唐惠儒教授主持，来自全国的4100余名专家、学者线上参加了本次论坛。

丁琛教授

丁琛，教授，博士生导师、Phenomics表型组学期刊执行主编、复旦大学人类表型组研究院副院长，中国生物物理学会表型组学分会创会秘书长，中国生化与分子生物学学会蛋白质组分会委员。科技部重点研发计划首席科学家、中组部“万人计划”领军人才、中组部“青年千人”、北京市“海聚工程”、北京市“优秀青年人才”、上海市“曙光人才”、上海市“优秀学科带头人”。主要从事蛋白质组学方面的研究。迄今共发表SCI文章70余篇，其中以通讯作者发表40余篇，包括Nat Biotechnol、 Nat Nanotechnol、 Cell Res、J Hematol Oncol（2篇）、Hepatology、Adv Sci、Sci Adv、Nat Commun（14篇）、J Exp Med、EMBO J、PNAS、eLife等，文章被引用4000余次。获批中/美专利5项，申请中国专利10项。

唐惠儒教授

论坛开始，主持人唐惠儒教授代表主办方对莅临的嘉宾及观众表示热烈欢迎，并对上海国际人类表型组研究院（IHPI）、Phenomics表型组学期刊、复旦大学人类表型组研究院（HuPI）、中国生物物理学会表型组学分会，以及演讲嘉宾丁琛教授做了简要而隆重的介绍。

报告中，丁琛教授首先分享了蛋白质组学的概念与优势。他指出现有的临床标志物仅能确诊少数疾病，不足以全面描述人体的生理病理状态，蛋白质组学可以获取人体不同状态的全蛋白表达图谱，从而高通量地筛选精细化诊断标志物。

随后，丁教授回顾了课题组关于蛋白质组学研究的瓶颈攻克工作，解决了包括蛋白质组深度覆盖检测耗时长、低丰度蛋白质难鉴定、蛋白质关系网络难解析等关键问题。团队通过建立高效蛋白质组检测平台与一站式数据云系统，提升了检测效率，将过去按周计算的检测一个样本几千种蛋白的流程时长缩短为半小时，并且开发了包含超算的Firmiana数据分析云平台用于数据处理。对于低丰度蛋白难鉴定的问题，团队提供了对功能活跃低丰度蛋白组的研究手段，开发了转录因子富集技术并申请了国内外专利。团队开发了贯穿信号转导途径的蛋白相互关系解析技术，搭建了细胞间配体—受体蛋白网络，可解析肝脏各类细胞构成原理和分工原则。

接着，丁琛教授重点介绍了团队在蛋白质组学临床研究应用方面的工作成果。团队开展了基因组学与蛋白组学研究，将癌症进展分成了22个小阶段进行深入分析，有效区分了各个阶段的基因突变与蛋白表达模式，揭示了食管癌变过程中糖酵解信号异常，PGK1蛋白可促进食管癌发展的关键现象。同时，团队还通过蛋白组学绘制了区域分辨率下的人类胃蛋白质组图谱，确定了不同区域下胃粘膜的功能特征，明确了不同区域胃癌的特色通道。去年，丁琛教授与北京大学肿瘤医院沈琳教授团队合作，理清了弥漫型胃癌（DGC）和肠型胃癌（IGC）的多组学整合分子分型，并利用胃癌的免疫微环境异质性揭示了免疫治疗有效性的潜在靶点，成功发现了CDK2和CDK1分别是DGC-C1和IGC-C3亚型的潜在靶点。针对转移灶鳞癌难以在病理上区分来源的问题，团队领导绘制了中国人鳞状细胞癌蛋白组学图谱，其中鳞状细胞癌和腺癌样本的蛋白质组学图谱揭示了差异激活的关键信号通路、临床和治疗相关亚组等，还构建了包含19个蛋白的诊断分类器，并验证了PRKCE、SLC27A1和CPXM2的诊断价值。

最后，丁教授简要介绍了团队在垂体瘤、胶质瘤、血浆蛋白解析患者生理病理状态等方面的工作进展。

在精彩的报告后，丁教授与观众们展开了热烈讨论。如有观众提问：“丁教授，您认为当前代谢蛋白组学领域需要解决的瓶颈问题有哪些?”丁教授答复：“首先是准确性，仅仅追求检测数目的增加在解决科学问题方面是不够的，通过精准检测产生可靠的生物学结论是最需要关注的；其次是检测精度方面的突破，例如空间分辨率、时间分辨率等方面的提升值得继续探索。”

生命天眼论：Phenomics表型组学前沿论坛将持续为大家提供高质量的讲座，第九十四期生命天眼论：Phenomics表型组学前沿论坛将于4月23日（下周二）晚上20:00-21:30举行，届时将由上海体育大学运动健康学院王茹教授，带来主题为“运动健康产业的发展机遇与挑战——高原低氧环境下的精准运动与代谢健康”的报告。敬请各位同仁关注！